講座報告主題：單細胞空間轉錄組中的非參數貝葉斯細胞類型識別
專家姓名：羅翔宇
日期：2025-04-28 時間：14:00
地點：數科院206會議室
主辦單位：數學科學學院
主講簡介：中國人民大學統計與大數據研究院長聘副教授、博士生導師。2018年博士畢業于香港中文大學統計系，2014年本科畢業于中國科技大學統計與金融系。羅翔宇以第一或通訊作者在JASA、AOAS、Nature Communications等國際統計或生物信息學期刊發表多篇研究論文。主持國家自然科學基金面上項目1項、青年項目1項。曾獲得美國統計學會頒發的W. J. Youden Award in Interlaboratory Testing。研究專長：貝葉斯統計、生物信息學、統計計算。
主講內容簡介：空間轉錄組學是一種快速發展的生物技術，能夠同步測定基因表達譜和空間位點的位置信息。隨著技術的不斷進步，當前的空間轉錄組技術已能實現細胞乃至亞細胞級別的分辨率，使得在組織切片內解析細胞類型的精細空間分布模式成為可能。然而，現有大多數空間細胞聚類方法都需要預先指定準確的細胞類型數量，而這在實際探索性數據分析中往往難以確定。為解決這一問題，我們提出了一個非參數貝葉斯模型BACT（Bayesian Cell Typing），通過整合基因表達信息和細胞空間坐標來進行細胞類型推斷。該模型引入了非參數波茨先驗以捕捉鄰近細胞間的空間依賴性，并創新性地實現了無需預先設定即可直接從數據中自動學習細胞類型數量的功能。在三個單細胞空間轉錄組數據集上的評估結果表明，BACT模型在性能上優于現有的空間細胞分型方法。
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